政府国有土地租赁合同50年期限，租金已一次性付

合同部分有效，超20年部分无效。依据《中华人民共和国合同法》，租赁合同期限超法定20年上限，超期部分法律不认可。不及时处理，将面临合同部分无效的法律风险。
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该合同不同情况处理如下：1.未超期，按原合同执行；2.超期，协商修改或重签。1.若合同未超20年，则继续履行原合同；2.若合同已超20年，则应与土地所有者协商修改合同或重新签订，以确保合同有效性。
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此合同问题常见的处理方式是确认合同部分有效及续签或修改。依据《中华人民共和国合同法》，面对合同超期问题，通常处理是确认原合同20年内有效部分并续签，或修改超期部分使其符合法定要求。选择方式时，应考虑土地使用者实际需求与法律规定相符。